中小型面粉機整個工藝分為原糧清理和制粉兩部分。該量大部分工藝流程分別如下：
一、原糧清理部分流程：原糧清理部分為也稱麥間，它又螺旋輸送機濕法清理（安裝有洗麥甩干機）和干法清理（安裝有去石機進行小麥著水）兩種形式供選擇。毛麥先流過麥倉柵網，分離出特大雜物，如繩頭、土塊、石塊等，然后由起立提升至卸料器，經卸料后流入篩組合清理機，分離出小麥中的大小雜質，并清理掉麥子表面扶著的泥塊、麥毛、麥皮上的塵土及部分麥殼。被清理后的小麥，經過氣力提升、溜篩后，進入去石機，去除小麥中的并肩石塊和并肩泥塊。若采用干法清理，再由起立將原糧提升至著水絞龍（安裝在潤麥倉上），經著水后即可進行潤麥；若采用濕法清理，則去石機所清理后的原糧，再進入洗麥機的洗麥絞龍中，在絞龍的作用下，使小麥中的并肩石塊和并肩泥塊進一步得到分離，并洗去麥粒表面和嵌入麥溝中的泥土、農藥、細菌、病毒等雜物，然后進行甩干，使小麥水分保持在13.5-14.5%之間（小麥水分的高低可通過調節著水時間來改變），末尾再提升至潤麥倉進行潤麥。經潤麥12-24小時后，就可以將凈麥提至粉間以備入磨制粉。中小型面粉機整個工作過程中，氣源有風機提供，在卸料器的卸料過程中，由于氣流的作用，輕雜質和灰塵也得到分離，這進一步強化了清理效果。
二、制粉流程：制粉部分也稱粉間。凈麥有起立輸送到第一皮磨的進料斗內，研磨后，經圓篩提粉，提出的面粉進入面粉匯集管內，篩上物（麥芯、麩皮）經過誘導式接料器，由起立輸送，進入第二皮磨上的剎克龍卸料器內，通過閉風器進入第二皮磨，繼續進行研磨。研磨后的物料，仍有圓篩提粉，面粉進入匯集管內，篩上物（麥芯、麩皮）再進入第三皮磨上的卸料器內...依次通過第五皮磨，五皮磨上的篩上物，通過管道由起立提升至最后一道圓篩，經篩理，其篩上物就是麩皮，由起立提升卸料后，即可進行麩打包。中小型面粉機所提出的面粉，仍進入匯集管，匯集管所收集的面粉，由氣流輸送到面粉卸料器內，通過閉風器進行打包。